27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3618 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  317  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  80.28 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  76.76 
 
 		 156 aa  243  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  74.32 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  73.94 
 
 		 154 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  73.94 
 
 		 154 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  73.94 
 
 		 154 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  73.94 
 
 		 154 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  74.65 
 
 		 155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  74.65 
 
 		 154 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  73.94 
 
 		 155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  74.65 
 
 		 154 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  74.65 
 
 		 154 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  73.24 
 
 		 154 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  73.24 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  38.89 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  37.24 
 
 		 335 aa  92  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  36.62 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  36.17 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  39.68 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  27.4 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  31.76 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  28.78 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  28.09 
 
 		 166 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  23.91 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  26.09 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  26.09 
 
 		 193 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>