25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0932 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  84.3 
 
 		 176 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  63.64 
 
 		 189 aa  241  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  65.73 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  63.16 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  63.16 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  51.88 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  53.75 
 
 		 170 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  52.15 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  50.3 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  50.31 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  48.54 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  44.59 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  37.28 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  37.76 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3199  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  26.85 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0385  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  26.17 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0193499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0417  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  25.5 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  25.33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3083  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  24.67 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0453  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  24.83 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  30.33 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  29.7 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  23.91 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>