20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4067 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  63.64 
 
 		 190 aa  241  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  64.29 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  63.79 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  64.53 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  63.95 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  55.19 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  54.72 
 
 		 170 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  54.94 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  54.32 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  54.37 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  51.92 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  47.4 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  39.16 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  40.56 
 
 		 155 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  29.1 
 
 		 158 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  27.7 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  39.22 
 
 		 75 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  32.08 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>