18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1402 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  370  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  43.02 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  43.75 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  43.35 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  42.2 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  41.9 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  40.96 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  40.96 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  37.28 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  75.34 
 
 		 75 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  39.16 
 
 		 189 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  38.73 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  35.5 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  37.43 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  35.26 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  32.75 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0561  hypothetical protein  80.39 
 
 		 55 aa  93.2  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  30.17 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>