18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2378 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  353  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  81.76 
 
 		 175 aa  288  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  81.44 
 
 		 179 aa  283  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  63.01 
 
 		 170 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  62.36 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  54.37 
 
 		 189 aa  168  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  51.85 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  53.37 
 
 		 166 aa  163  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  51.23 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  50.9 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  48.54 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  49.07 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  43.75 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  47.1 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  40.14 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  59.26 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  28.97 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  27.74 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>