18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0677 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  350  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  76.51 
 
 
178 aa  261  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  63.43 
 
 
175 aa  222  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  63.01 
 
 
173 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  64.85 
 
 
179 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  55.9 
 
 
193 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  55.9 
 
 
193 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  55.42 
 
 
166 aa  174  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  54.72 
 
 
189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  53.75 
 
 
190 aa  168  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  53.46 
 
 
159 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  51.5 
 
 
185 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  52.26 
 
 
176 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  42.2 
 
 
177 aa  148  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  38.03 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  57.14 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  26.21 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  31.96 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>