33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4817 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  61.58 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  53.57 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  47.93 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  47.93 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  47.73 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  47.71 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  49.3 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  48.57 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  48.34 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  48.15 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  47.71 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  49.08 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  44.02 
 
 		 218 aa  140  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  51.35 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  33.07 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  27.98 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  33.33 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  31.45 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  31.45 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  28.93 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  31.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  25.21 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  26.76 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  30.08 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  29.85 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  24.65 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  31.06 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  27.64 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  29.06 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  41.67 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  26.52 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>