38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3713 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  410  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  47.41 
 
 
186 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  48.15 
 
 
186 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  46.38 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  37.21 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  40.67 
 
 
185 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  40.46 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  43.88 
 
 
227 aa  91.7  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  43.88 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  41.5 
 
 
237 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  46.21 
 
 
230 aa  89  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  41.51 
 
 
238 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  53.09 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  40.15 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  33.79 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  31.03 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  31.03 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  31.03 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  58.54 
 
 
50 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  30.88 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  30.43 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003498  hypothetical protein  25.99 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  28.87 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  34.33 
 
 
218 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  32.26 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  28.36 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  37.68 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  31.67 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  35.04 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  37.5 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  28.79 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  34.07 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  31.43 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  34.07 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  26.95 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  32.31 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  28.15 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>