26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2446 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  48.77 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  43.14 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  44.3 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  44.22 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  41.96 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  36.25 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3200  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5275  hypothetical protein  39.71 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  40.52 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  31.78 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  28.35 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  26.71 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  26.71 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  24.07 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  26.71 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  29.22 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  24.48 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  30.16 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  32.52 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  25.58 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  25.83 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  35.19 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  26.71 
 
 		 222 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>