36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3912 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  88.79 
 
 		 218 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  87.89 
 
 		 218 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  78.57 
 
 		 218 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  63.51 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  61.78 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  61.33 
 
 		 222 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  61.33 
 
 		 222 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  60.89 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  48.85 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  49.32 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  48.37 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  47.85 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  43.67 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  45.45 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  35.17 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  29.58 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  31.65 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  30.25 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  28.76 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  27.16 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  28.42 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  30.99 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  37.31 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  44.64 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  29.5 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  29.66 
 
 		 335 aa  45.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  29.5 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  32.43 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  26.62 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  31.51 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  32.18 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  24.07 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  24.89 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>