31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0055 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  51.42 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  49.77 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  49.77 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  49.33 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  53.77 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  49.55 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  48.15 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  49.77 
 
 		 222 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  57 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  52.09 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  46.63 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  41.23 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  33.1 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  30.37 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  32.26 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  29.21 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  40.62 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  26.6 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  30.13 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  26.06 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  28.24 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  26.42 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  26.62 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  31.39 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  33.7 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  28.28 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  31.97 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>