32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3787 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  95.41 
 
 		 218 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  86.94 
 
 		 222 aa  357  9e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  80.28 
 
 		 218 aa  351  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  65 
 
 		 218 aa  264  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  63.6 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  60.96 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  60.96 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  62.72 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  49.77 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  48.34 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  48.02 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  48.1 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  41.45 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  49.32 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  33.57 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  27.4 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  29.63 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  29.71 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  28.99 
 
 		 185 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  44.64 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  28.22 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  37.31 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  29.56 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  44.64 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  30.95 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  30.95 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  30.68 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  26.43 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  36.07 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  31.09 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>