34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1401 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  40.12 
 
 		 227 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  40.34 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  41.29 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  39.86 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  39.86 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  40.26 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  43.06 
 
 		 237 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  40.15 
 
 		 230 aa  97.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  37.5 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  37.89 
 
 		 238 aa  94.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  43.75 
 
 		 185 aa  94.4  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  36.63 
 
 		 209 aa  92  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  47.12 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  85.71 
 
 		 50 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  29.93 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  27.98 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  26.88 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  27.81 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  27.17 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  27.75 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  28.39 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  26.32 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  31.09 
 
 		 221 aa  50.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  26.89 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  32.35 
 
 		 243 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003498  hypothetical protein  35.82 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.79 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  26.8 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  28.05 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  37.29 
 
 		 214 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>