30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02273 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003498  hypothetical protein  57.75 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  40.62 
 
 		 221 aa  88.2  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  32.59 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  29.52 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  31.01 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  33.94 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  33.33 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  32.81 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  33.53 
 
 		 335 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  26.26 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  27.52 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  41.82 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  25.76 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  29.51 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  28.47 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  29.5 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  23.53 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  26.92 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  24.54 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  32.14 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  46.34 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  27.97 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  39.22 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  24.65 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  27.97 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  23.88 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  26.53 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>