33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4132 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  97.3 
 
 
222 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  97.75 
 
 
222 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  97.3 
 
 
222 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  61.71 
 
 
218 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  62.33 
 
 
218 aa  244  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  63.16 
 
 
218 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  62.28 
 
 
218 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  61.5 
 
 
222 aa  231  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  47.35 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  47.93 
 
 
197 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  49.77 
 
 
216 aa  167  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  50.95 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  49.32 
 
 
218 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  63.16 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  28.28 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  31.17 
 
 
186 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  31.87 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  31.87 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  32.37 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  33.33 
 
 
185 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  29.88 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  36.99 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  31.13 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  24.69 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  37.7 
 
 
218 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  32.05 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  42.86 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  30.43 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  27.57 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  25.79 
 
 
194 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>