39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2795 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  98.24 
 
 
227 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  45.04 
 
 
227 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  42.62 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  42.55 
 
 
237 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  50 
 
 
209 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  47.22 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  44.44 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  44.23 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  47.14 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  39.86 
 
 
184 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  43.57 
 
 
186 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  58.44 
 
 
189 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  42.65 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  34.81 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  35.51 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  65.79 
 
 
50 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  32.92 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  32.92 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  31.45 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  32.1 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  31.87 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  29.25 
 
 
335 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5275  hypothetical protein  30.21 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  27.59 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  28.66 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  27.89 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  32.79 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  27.03 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  31.52 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  28.23 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  32.31 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  30 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  30.16 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  25.78 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  35.54 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>