37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4102 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  97.75 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  97.3 
 
 		 222 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  61.71 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  62.78 
 
 		 218 aa  248  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  61.43 
 
 		 218 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  61.88 
 
 		 218 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  61.5 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  49.54 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  47.93 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  49.32 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  50.71 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  49.32 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  63.04 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  31.82 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  32.64 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  30.63 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  28.57 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  30.63 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  31.79 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  27.59 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  36.99 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  25.31 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  27.54 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  37.7 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  34.85 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  42.86 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  33.07 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  26.71 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  29.45 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  28.91 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  25.14 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  27.57 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>