27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3265 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  49 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  45.04 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  44.63 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  42.63 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  44.44 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  46.5 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  43.95 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  44.24 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  43.31 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  42.04 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  62.34 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  41.88 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  50.75 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  32.21 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  68.42 
 
 		 50 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  25.29 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  31.72 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  25.86 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  25.86 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  26.42 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  25.93 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  25.31 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  24.65 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  29.88 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  34.21 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>