35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0678 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  100 
 
 		 185 aa  361  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  70.71 
 
 		 202 aa  190  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  59.29 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  56.74 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  56.72 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  55.64 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  42.78 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  50.31 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  39.41 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  43.59 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  38.85 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  40.11 
 
 		 238 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  37.65 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  31.78 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  75.68 
 
 		 50 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  31.88 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  32.64 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  32.64 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  28.99 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  30.28 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  28.93 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  29.78 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  26.37 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  36.22 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  25.95 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003498  hypothetical protein  32.81 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  30.58 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>