19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3123 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  40.54 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  38.24 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  37.58 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  41.48 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  39.24 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  40.94 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5275  hypothetical protein  43.8 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3200  hypothetical protein  37.91 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  30.3 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  27.23 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  25.63 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  28.43 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  31 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  29.06 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  30.83 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  30.58 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>