24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0398 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  36.56 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  43.62 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  28.67 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  31.53 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  32.5 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  39.66 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  32.98 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  37.7 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  37.7 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  37.7 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  30.17 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  28.14 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  34.21 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  30.3 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  29.46 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  36.07 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  34.55 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  37.21 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  43.4 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  32.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  37.35 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  36.14 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>