35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4505 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  80.28 
 
 		 218 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  77.98 
 
 		 218 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  78.12 
 
 		 222 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  62.73 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  63.23 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  62.78 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  62.78 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  61.88 
 
 		 222 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  49.77 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  49.3 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  49.77 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  46.04 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  48.97 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  48.65 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  32.62 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  33.8 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  31.88 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  28.33 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  31.17 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  28.39 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  32.82 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  26.21 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  29.55 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  27.6 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  29.73 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  31.62 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  27.21 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  44.64 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  36.36 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  34.62 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  24.66 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  37.7 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  27.52 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  28.03 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>