32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3716 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  95.41 
 
 		 218 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  86.49 
 
 		 222 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  77.98 
 
 		 218 aa  341  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  64.09 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  62.72 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  61.06 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  61.06 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  61.84 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  48.83 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  46.76 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  47.66 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  47.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  41.45 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  46.06 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  34.04 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  32.06 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  26.88 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  31.16 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  29.11 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  30.37 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  37.31 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  25.45 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  29.19 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  44.64 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  30.68 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  31.03 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  27.41 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  27.41 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  25.83 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  26.57 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>