22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0454 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  463  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  63.6 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  63.2 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3200  hypothetical protein  53.3 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  57.49 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5275  hypothetical protein  74.39 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102357  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  35.91 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  40.54 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  40.13 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  42.18 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  34.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  34.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  31.33 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  37.5 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  32.19 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  35.61 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  24.66 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  29.46 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  30.28 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  28.68 
 
 		 222 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  28.68 
 
 		 222 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>