17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5275 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5275  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  53.5 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  46.25 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  44.84 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3200  hypothetical protein  54.19 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  53.95 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  39.53 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  37.82 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  36.03 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  45.26 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  31.47 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  30.46 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  29.65 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  33.62 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  35.29 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  32.08 
 
 		 335 aa  41.6  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>