23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003498 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003498  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  57.75 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  42.47 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  31.47 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  35.82 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  30.39 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  32.81 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  30.08 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  24.35 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  30.95 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  32.62 
 
 		 335 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  32 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  27.91 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  28.87 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  28.87 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  40 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  28.22 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  25.34 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  27.81 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  27.81 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  28.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  28.07 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>