80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06642 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  88.16 
 
 		 228 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  61.24 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  60 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  41.18 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  47.83 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  41.32 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  41.74 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  38.64 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  41.74 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  28.04 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  29.91 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  34.86 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  28.99 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  30.92 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  31.39 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  27.84 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  28.09 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  32.65 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  32.48 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  34.91 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  28.04 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  35.48 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  26.96 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  32.26 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  26.5 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  32 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  34.92 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  38.46 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  36.07 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  31 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  37.7 
 
 		 405 aa  45.4  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  36.84 
 
 		 469 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 393 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  24.82 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  34.43 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  45.45 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  58.06 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  35.59 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.24 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  47.73 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  38.33 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  31.76 
 
 		 752 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  27.17 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  38.78 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  38.6 
 
 		 509 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  40.38 
 
 		 700 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  30.7 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  47.83 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  35.19 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  35.19 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  36.07 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  31.91 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  28.78 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  36.51 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  30.65 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17765  VIC family transporter: potassium ion channel, potassium voltage-gated channel, subfamily H (Eag-related)  38.33 
 
 		 735 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000050158  hitchhiker  0.00697656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  47.5 
 
 		 149 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 		 396 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  27.05 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  30.65 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  37.5 
 
 		 271 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  33.8 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  33.8 
 
 		 278 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  33.8 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  33.8 
 
 		 278 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  33.8 
 
 		 278 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  25.53 
 
 		 807 aa  42  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  57.58 
 
 		 279 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  43.14 
 
 		 438 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>