159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05609 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05609  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  292  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04738  cytochrome b561  62.26 
 
 		 195 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0135  putative cytochrome b561  48.54 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4238  cytochrome B561  41.35 
 
 		 176 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.295562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  48.08 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  33.63 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  36.19 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.9 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  32.43 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  31.25 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  33.94 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.51 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.63 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.48 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18060  hypothetical protein  39.6 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.645092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.63 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  33.04 
 
 		 203 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  34.68 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  34.68 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  34.68 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.74 
 
 		 193 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  32.65 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  33.93 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  30.36 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  31.08 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.36 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.36 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  33.33 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.36 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.36 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  29.46 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  29.46 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  33.04 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  29.46 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  31.25 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  31.43 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.27 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  34.19 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1418  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  31.63 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.9 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.62 
 
 		 187 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.71 
 
 		 213 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.38 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  26.67 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  29.82 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  31.48 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  28.04 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.48 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  35.96 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  32.61 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  32.61 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  31.94 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  28.07 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  27.33 
 
 		 183 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  32.61 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  29.57 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  25 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.11 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.17 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  33.96 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  30.36 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.09 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  27.52 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.52 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.31 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  29.23 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  31.96 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  32.69 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.46 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  30.77 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  33.98 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  30.63 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  29.41 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  35.24 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  30.36 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  29.52 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  29.9 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  27.52 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  30.69 
 
 		 406 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  28.97 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  28.97 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  29.51 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  30.34 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  31.37 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.84 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  30.34 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  29.84 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  29.73 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  30.77 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  29.03 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  28.77 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  30.34 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  27.35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  29.73 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>