More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05495 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05495  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  86.9 
 
 		 290 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  68.42 
 
 		 290 aa  411  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 295 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0816  protoheme IX farnesyltransferase  49.47 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0839  protoheme IX farnesyltransferase  49.47 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4372  protoheme IX farnesyltransferase  49.47 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0853  protoheme IX farnesyltransferase  48.75 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  47.77 
 
 		 296 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  49.12 
 
 		 296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  47.42 
 
 		 296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  48.04 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  48.41 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  47.69 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  47.33 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  47.89 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  47.54 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0093  protoheme IX farnesyltransferase  48.78 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3862  protoheme IX farnesyltransferase  46.98 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0958  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4035  protoheme IX farnesyltransferase  46.83 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3827  protoheme IX farnesyltransferase  46.83 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  46.45 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1294  protoheme IX farnesyltransferase  45.64 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3918  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4222  protoheme IX farnesyltransferase  46.26 
 
 		 310 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4150  protoheme IX farnesyltransferase  46.26 
 
 		 310 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  44.95 
 
 		 288 aa  249  6e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4354  protoheme IX farnesyltransferase  46.38 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0429  protoheme IX farnesyltransferase  45.39 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  46.62 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0370  protoheme IX farnesyltransferase  46.45 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  37.87 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0982  protoheme IX farnesyltransferase  37.13 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1854  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  36.82 
 
 		 622 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  35.4 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  32.4 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  40.3 
 
 		 317 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3771  protoheme IX farnesyltransferase  33.7 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.953397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3992  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3857  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00164429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3688  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.583143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3705  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000950979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4047  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4063  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4155  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3960  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1192  protoheme IX farnesyltransferase  34.33 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  35.74 
 
 		 535 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  34.05 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  31.25 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  31.25 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  35.04 
 
 		 534 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  36.86 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  34.5 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  35.5 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  35.5 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  35.65 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  35.5 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0706  protoheme IX farnesyltransferase  39.62 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1198  protoheme IX farnesyltransferase  39.15 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  34.05 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  36.87 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1176  protoheme IX farnesyltransferase  39.15 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2647  protoheme IX farnesyltransferase  33.09 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  30.6 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1429  protoheme IX farnesyltransferase  37.14 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0844546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  30.77 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  30.37 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  29.52 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  31.09 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  29.45 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  32.07 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  29.26 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>