165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03117 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  88.31 
 
 		 154 aa  288  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  69.03 
 
 		 157 aa  233  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  50.66 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.29 
 
 		 156 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.35 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  40 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  45.39 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  42.45 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.06 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.25 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.99 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.99 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.99 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.99 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.06 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.35 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.31 
 
 		 161 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  39.35 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.42 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  38.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  36.36 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  40.94 
 
 		 181 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  36.13 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  35.26 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  36.77 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  37.75 
 
 		 158 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.06 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  38.19 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.1 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  37.24 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  36.55 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.76 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.76 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  35.21 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.41 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.91 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  37.82 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.32 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.5 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  35.2 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  37.7 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.73 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.04 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  30.5 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.03 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.85 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.64 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.51 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  28.93 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  28.93 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  28.93 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  28.93 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.46 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.69 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.47 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  28.1 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  28.1 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  28.93 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.22 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.83 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  25.17 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  28.91 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.56 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  27.08 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1257  phosphohistidine phosphatase, SixA  22.93 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.204304  normal  0.125105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.8 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>