More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02520 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  45.77 
 
 
951 aa  822    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  61.33 
 
 
938 aa  1224    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  46.69 
 
 
949 aa  854    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  100 
 
 
941 aa  1932    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  46.36 
 
 
935 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  40.37 
 
 
951 aa  706    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  69.84 
 
 
948 aa  1399    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  47.14 
 
 
926 aa  868    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  46.36 
 
 
935 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  46.15 
 
 
935 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  46.13 
 
 
914 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  46.46 
 
 
931 aa  815    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  40.85 
 
 
952 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  45.52 
 
 
918 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  45.79 
 
 
918 aa  794    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  44.16 
 
 
986 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  45.37 
 
 
918 aa  797    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  43.64 
 
 
966 aa  782    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  95.96 
 
 
936 aa  1861    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  51.58 
 
 
939 aa  978    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  45.92 
 
 
961 aa  834    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  45.52 
 
 
918 aa  794    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  46.17 
 
 
942 aa  825    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  40.37 
 
 
956 aa  705    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  41.16 
 
 
951 aa  705    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  45.57 
 
 
918 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  40.75 
 
 
925 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  40.27 
 
 
929 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  40.4 
 
 
929 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  38.51 
 
 
936 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  38.25 
 
 
987 aa  579  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  36.79 
 
 
906 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  35.89 
 
 
971 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  35.25 
 
 
961 aa  525  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  39.85 
 
 
622 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  39.97 
 
 
658 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  39.62 
 
 
620 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  39.56 
 
 
615 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  37.68 
 
 
606 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  38.75 
 
 
619 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  38.63 
 
 
621 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  39.47 
 
 
613 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  37.58 
 
 
631 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  36.97 
 
 
627 aa  386  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  38.45 
 
 
643 aa  386  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  39.62 
 
 
613 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  36.82 
 
 
627 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  38.13 
 
 
610 aa  386  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  39.62 
 
 
613 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  36.23 
 
 
651 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  39.31 
 
 
613 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  39.47 
 
 
613 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  35.91 
 
 
654 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  38.92 
 
 
622 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  39.37 
 
 
614 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  39.49 
 
 
615 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  38.79 
 
 
637 aa  376  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  39.31 
 
 
613 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  37.85 
 
 
636 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  38.07 
 
 
636 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  38.84 
 
 
615 aa  370  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  38.68 
 
 
615 aa  366  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  38.68 
 
 
615 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  38.73 
 
 
619 aa  363  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  38.54 
 
 
596 aa  362  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  35.35 
 
 
592 aa  319  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  37.19 
 
 
513 aa  305  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  30.55 
 
 
650 aa  95.1  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0633  chaperone protein HscA  26.91 
 
 
617 aa  84.3  0.000000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.672596  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1452  molecular chaperone DnaK  26.94 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  27.8 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  29.45 
 
 
625 aa  80.9  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  23.75 
 
 
527 aa  79  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0406  heat shock protein Hsp70  26.25 
 
 
618 aa  79  0.0000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0892  chaperone protein HscA  24.07 
 
 
582 aa  78.2  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  29.41 
 
 
625 aa  78.2  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1136  chaperone protein HscA  28.1 
 
 
620 aa  78.2  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  28.09 
 
 
623 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  29.22 
 
 
622 aa  75.1  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0201  chaperone protein DnaK  28.57 
 
 
621 aa  74.7  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00131999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  32.93 
 
 
622 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2159  chaperone protein HscA  31.53 
 
 
622 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.265898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  29.58 
 
 
618 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  29.75 
 
 
566 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3231  Fe-S protein assembly chaperone HscA  29.2 
 
 
628 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.124104 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0988  heat shock protein 70  40.19 
 
 
105 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  32.43 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  32.43 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05490  chaperone protein DnaK  29.07 
 
 
631 aa  72.8  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  30.12 
 
 
620 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  32.23 
 
 
622 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  31.23 
 
 
622 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1316  heat shock protein Hsp70  28.52 
 
 
737 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.111752  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3621  molecular chaperone DnaK  30.8 
 
 
623 aa  72  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  27.59 
 
 
623 aa  71.6  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  30.84 
 
 
623 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2313  chaperone protein HscA  30.1 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3058  Fe-S protein assembly chaperone HscA  27.61 
 
 
625 aa  71.2  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156857  unclonable  0.00000109357 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2595  chaperone protein HscA  29.73 
 
 
622 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.899432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2651  chaperone protein HscA  29.73 
 
 
622 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>