More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01497 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01497  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02582  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08198  ArsR family transcriptional regulator  95.92 
 
 		 98 aa  193  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  37.63 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  31.46 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  32.58 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  29.07 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  28.24 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  29.89 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  29.76 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  28.41 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 291 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  31.71 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 103 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  29.11 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  28.57 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  31.4 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  31.4 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 355 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  28.24 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  28.4 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 276 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 121 aa  48.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  27.08 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2994  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>