42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002838 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  719    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  72.19 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  55.76 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  46.88 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  47.57 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  44.86 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  43.4 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  44.59 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  50.91 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  53.79 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  53.79 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  53.79 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  48.42 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  46.52 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  46.93 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  41.55 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  48.48 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  32.79 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  50 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  48.13 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  44.32 
 
 		 238 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  37.86 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  46.94 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  38.14 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  44.06 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  44.06 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  44.06 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  42.38 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  40 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  43.33 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  43.33 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  42.67 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  43.66 
 
 		 265 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  42.67 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.79 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  36.67 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  38.3 
 
 		 247 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  34.39 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  37.75 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  31.08 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3849  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  46.51 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  57.89 
 
 		 539 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>