More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1728 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  100 
 
 
378 aa  758    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  75.53 
 
 
377 aa  584  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  75.27 
 
 
377 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  64.89 
 
 
377 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  62.23 
 
 
377 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  64.89 
 
 
377 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  61.54 
 
 
402 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  64.63 
 
 
377 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  63.3 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  63.83 
 
 
377 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  63.83 
 
 
377 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  62.77 
 
 
376 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  60.11 
 
 
375 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  60 
 
 
378 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  62.5 
 
 
376 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  60.42 
 
 
379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  58.62 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  60.42 
 
 
379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  58.18 
 
 
384 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  57.92 
 
 
384 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  61.17 
 
 
376 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  48.13 
 
 
374 aa  352  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  47.86 
 
 
374 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  45.18 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  44.67 
 
 
393 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  44.53 
 
 
387 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  40.38 
 
 
468 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  39.96 
 
 
467 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  42.33 
 
 
405 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  40.89 
 
 
395 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.18 
 
 
319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  40.43 
 
 
404 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  41.8 
 
 
319 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.55 
 
 
392 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  40.36 
 
 
390 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  40.36 
 
 
390 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  38.65 
 
 
404 aa  244  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  40.86 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  39.95 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  38.66 
 
 
462 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  38.92 
 
 
376 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  37.53 
 
 
380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  48.48 
 
 
492 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  37.31 
 
 
383 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  36.59 
 
 
437 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  39.24 
 
 
431 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  40.16 
 
 
272 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  38.1 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  38.1 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  39.63 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  37.01 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  64.02 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  64.02 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  37.25 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  60.95 
 
 
488 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  38.62 
 
 
272 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  36.1 
 
 
379 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  36.56 
 
 
356 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  37.95 
 
 
412 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  35.8 
 
 
386 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  59.51 
 
 
482 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  53.93 
 
 
687 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  60.49 
 
 
481 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 
386 aa  202  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  44.79 
 
 
494 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  35.43 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  62.73 
 
 
517 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.19 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  34.6 
 
 
387 aa  200  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  36.71 
 
 
388 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  62.11 
 
 
516 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  35.84 
 
 
384 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  35.84 
 
 
384 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  35.84 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  35.84 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  35.84 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  35.84 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  35.84 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  35.84 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  35.53 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  35.84 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  35.64 
 
 
383 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  58.66 
 
 
294 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  36.02 
 
 
372 aa  189  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  43.27 
 
 
483 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  34.59 
 
 
420 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  53.85 
 
 
475 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  53.85 
 
 
475 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  51.89 
 
 
492 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  36.43 
 
 
385 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  55.03 
 
 
272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  55.03 
 
 
272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  52.75 
 
 
271 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  52.75 
 
 
271 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  54.65 
 
 
274 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  53.45 
 
 
271 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  53.45 
 
 
271 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  54.39 
 
 
271 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  54.39 
 
 
271 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  56.29 
 
 
490 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>