More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0124 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  493  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  83.68 
 
 
240 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  83.61 
 
 
238 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  85.46 
 
 
227 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  71.61 
 
 
240 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  71.97 
 
 
243 aa  364  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  70.83 
 
 
241 aa  360  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  70.34 
 
 
241 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  68.07 
 
 
240 aa  345  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  66.81 
 
 
240 aa  344  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  68.62 
 
 
240 aa  344  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  68.62 
 
 
240 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  67.08 
 
 
241 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  67.78 
 
 
240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  68.2 
 
 
240 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  67.36 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  66.81 
 
 
241 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  67.78 
 
 
242 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  66.95 
 
 
240 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  66.95 
 
 
240 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  66.95 
 
 
240 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  67.78 
 
 
240 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  66.53 
 
 
240 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  68.07 
 
 
241 aa  334  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  65.83 
 
 
242 aa  331  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  67.93 
 
 
238 aa  329  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  64.41 
 
 
237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  64.44 
 
 
240 aa  316  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  65.4 
 
 
238 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  60.25 
 
 
239 aa  301  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  45.53 
 
 
238 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  45 
 
 
238 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  44.26 
 
 
238 aa  204  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  43.28 
 
 
239 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  42.86 
 
 
239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  42.98 
 
 
238 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  43.22 
 
 
238 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  44.49 
 
 
238 aa  192  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  45.64 
 
 
237 aa  192  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  42.68 
 
 
238 aa  191  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  43.51 
 
 
239 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  42.02 
 
 
239 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  42.98 
 
 
238 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  43.1 
 
 
242 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  42.98 
 
 
238 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  42.98 
 
 
238 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  42.68 
 
 
238 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  42.68 
 
 
238 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  42.13 
 
 
234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  41.91 
 
 
237 aa  176  3e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  38.36 
 
 
246 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  38.36 
 
 
246 aa  168  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  38.36 
 
 
246 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  38.36 
 
 
246 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  38.36 
 
 
246 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  38.36 
 
 
246 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  37.93 
 
 
246 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  44.8 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  44.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  44.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  44.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  44.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  44.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  44.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  44.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  43.24 
 
 
239 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  39.91 
 
 
248 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  39.91 
 
 
248 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  39.91 
 
 
248 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  44.04 
 
 
242 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  43.64 
 
 
242 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  39.48 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  38.36 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  43.64 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  43.64 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  37.77 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  43.18 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  38.2 
 
 
248 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  41.48 
 
 
250 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>