237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0639 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0639  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  44.19 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  44.24 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  43.26 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  41.67 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  42.33 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  42.59 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  42.59 
 
 		 229 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  42.59 
 
 		 229 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  42.59 
 
 		 229 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  42.59 
 
 		 229 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  45.12 
 
 		 244 aa  174  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  41.2 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  43.93 
 
 		 232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  41.86 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  44.34 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  43.58 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  43.52 
 
 		 253 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  40.65 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 231 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  40.65 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  42.52 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  40.47 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  40.65 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  40.65 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  43.19 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  44.86 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  40.38 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  41.86 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  41.98 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  41.86 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  41.12 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  39.72 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  41.55 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  42.25 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  39.07 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  43.46 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  42.25 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  41.59 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  41.04 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  41.94 
 
 		 247 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  42.2 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  42.52 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  43.46 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  42.33 
 
 		 230 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  43.19 
 
 		 230 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  42.55 
 
 		 226 aa  160  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  41.94 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  41.86 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  42.99 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  42.35 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  42.33 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  46.03 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  41.67 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl243  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  45.5 
 
 		 268 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  43.09 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>