More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0489 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  173  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 85 aa  130  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 85 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 88 aa  127  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 92 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 82 aa  106  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 		 94 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  63.86 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  67.14 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  69.57 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>