More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1002 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  312  9e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  97.44 
 
 		 156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  63.4 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  59.86 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  51.63 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 175 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  46.41 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  42.48 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  46.21 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  43.87 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  46.1 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  48.2 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  41.14 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  39.6 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  46.88 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  44.22 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  47.48 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  41.03 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  42.96 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>