More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0508 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0508  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 394 aa  805    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0486216  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0821  alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4382  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.01 
 
 		 384 aa  275  8e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0404096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  35.83 
 
 		 350 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  35.83 
 
 		 350 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.83 
 
 		 350 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.28 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.28 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.56 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.56 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 		 336 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.97 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.51 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.63 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  33.24 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  33.52 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 		 349 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 		 350 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  33.93 
 
 		 348 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  33.43 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  28.17 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.23 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.27 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.78 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  29.01 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.68 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 345 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.86 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.58 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 		 362 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.45 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  28.65 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  27.61 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  28.65 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  28.45 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  30.48 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  27.84 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.35 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.92 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  32.03 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  27.84 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  27.61 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 		 341 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  27.61 
 
 		 342 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 		 349 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.74 
 
 		 344 aa  136  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  28 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  33.04 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.96 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.48 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  27.5 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.83 
 
 		 349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>