67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1388 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  38.05 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  37.56 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  41.87 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  38.5 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  28.64 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  35.47 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  30.45 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  32.77 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 138 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  36.67 
 
 		 124 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 128 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  30.67 
 
 		 129 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 138 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  30.67 
 
 		 129 aa  45.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 131 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 144 aa  45.1  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  29 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  31.76 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  29 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 122 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 129 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 288 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 132 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 141 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 146 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 135 aa  42  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  32.43 
 
 		 170 aa  41.6  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 148 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>