68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_R0024 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  200  5e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  96.94 
 
 		 98 bp  170  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  95.05 
 
 		 101 bp  161  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  92.08 
 
 		 98 bp  123  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  90.1 
 
 		 101 bp  121  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  89.11 
 
 		 101 bp  113  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  89.11 
 
 		 98 bp  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  93.7  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  86.87 
 
 		 98 bp  89.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  97.87 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  84.69 
 
 		 95 bp  71.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 78 bp  69.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 99 bp  69.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 78 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  100 
 
 		 119 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  100 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  56  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 94 bp  54  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 94 bp  54  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 104 bp  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0038  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0079  tRNA-OTHER  100 
 
 		 121 bp  46.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  88.1 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>