38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2188 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  65.15 
 
 		 492 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1031    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  45.67 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  46.12 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  37.74 
 
 		 622 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  39.26 
 
 		 628 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  36.48 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  37.74 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  36.48 
 
 		 505 aa  260  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  36.71 
 
 		 515 aa  259  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  35.82 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  49.53 
 
 		 624 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  49.53 
 
 		 624 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  30.64 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  31.53 
 
 		 551 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  46.46 
 
 		 585 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  42.34 
 
 		 624 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  49.52 
 
 		 602 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  24.66 
 
 		 580 aa  87  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  46.67 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  27.27 
 
 		 605 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  46.08 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  41.23 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  42.99 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  39.02 
 
 		 935 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  40.91 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  23.95 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  39.02 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  36.62 
 
 		 631 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  42.31 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  28.28 
 
 		 678 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  36.76 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  39.82 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4602  hypothetical protein  28.7 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.902836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  29.5 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  28.05 
 
 		 522 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  22.78 
 
 		 676 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0153  hypothetical protein  29.77 
 
 		 707 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00172634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>