More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1734 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.580513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.86 
 
 
310 aa  505  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0433  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.42 
 
 
313 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0859322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.42 
 
 
313 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.99 
 
 
441 aa  359  4e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.188781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.14 
 
 
292 aa  346  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000129545  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 
288 aa  271  7e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
305 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
340 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
347 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435279  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
494 aa  205  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
295 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
299 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
299 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
298 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
496 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
485 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.26 
 
 
299 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  38.26 
 
 
299 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  38.26 
 
 
299 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.26 
 
 
299 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  38.26 
 
 
299 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
356 aa  198  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.08 
 
 
479 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
300 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.7 
 
 
317 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
300 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
495 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
497 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  42.74 
 
 
279 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  38.96 
 
 
300 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
288 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
299 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  40 
 
 
473 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  36.49 
 
 
284 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
293 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
469 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  36.36 
 
 
301 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
289 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
299 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
274 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
313 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
310 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
313 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
359 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
310 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  41.13 
 
 
282 aa  189  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
310 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
299 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
337 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
287 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.39 
 
 
289 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
309 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
284 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0968091  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11070  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.03 
 
 
318 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
285 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
301 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
304 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  36.96 
 
 
299 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
299 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
300 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
280 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
280 aa  185  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
311 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  35.67 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
297 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
307 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
301 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
297 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.95 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  41.27 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.65 
 
 
284 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
301 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
297 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
285 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
304 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
282 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.62 
 
 
303 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.62 
 
 
303 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
280 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
301 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.62 
 
 
303 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
303 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>