More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1360 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1360  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 454 aa  926    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.949165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0476  aspartate ammonia-lyase  72.59 
 
 		 458 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0491  aspartate ammonia-lyase  72.59 
 
 		 458 aa  682    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0246  aspartate ammonia-lyase  67.47 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.050707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1630  aspartate ammonia-lyase  45.63 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  46.29 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  45.63 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1493  aspartate ammonia-lyase  44.23 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  46.83 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1389  aspartate ammonia-lyase  43.1 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0123141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0184  fumarate lyase  45.75 
 
 		 488 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  45.85 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  47.07 
 
 		 472 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1842  aspartate ammonia-lyase  42.61 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3552  aspartate ammonia-lyase  42.61 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.314988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  41.96 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  42.92 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  42.05 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  40.87 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  40.17 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  40.17 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  40.17 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  40.17 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  39.96 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  40.74 
 
 		 471 aa  332  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  40.79 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  39.96 
 
 		 476 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 475 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  39.96 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  41.61 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  40.39 
 
 		 475 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  40.39 
 
 		 475 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  40.13 
 
 		 477 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  40.13 
 
 		 477 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  40.74 
 
 		 475 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  39.91 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  41.61 
 
 		 471 aa  324  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  39.91 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  39.91 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  39.91 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  39.69 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  40.39 
 
 		 471 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  39.69 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  39.91 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  40.52 
 
 		 474 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  39.22 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  39.69 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  39.96 
 
 		 479 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  39.96 
 
 		 479 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  39.96 
 
 		 479 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  39.96 
 
 		 479 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  38.78 
 
 		 479 aa  319  7.999999999999999e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  40.31 
 
 		 467 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  39.25 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  40.17 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  37.99 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  39.43 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  40.17 
 
 		 471 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  38.65 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  40.17 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  39.04 
 
 		 521 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  42.31 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  42.31 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  38.65 
 
 		 466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  40.09 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  42.31 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  40.45 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  39.74 
 
 		 476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  39.74 
 
 		 476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  39.52 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  39.74 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  41.41 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  39.74 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  37.94 
 
 		 475 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  36.6 
 
 		 480 aa  313  5.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  39.74 
 
 		 476 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  39.08 
 
 		 479 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  41.41 
 
 		 483 aa  312  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  39.31 
 
 		 476 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  39.52 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  37.72 
 
 		 468 aa  310  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.47 
 
 		 466 aa  310  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  37.99 
 
 		 469 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  37.72 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  37.72 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  42.07 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  41.97 
 
 		 484 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  39.26 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  39.16 
 
 		 479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  38.82 
 
 		 470 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  39.74 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  39.74 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0153  fumarase  38.26 
 
 		 476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  39.3 
 
 		 481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  36.9 
 
 		 469 aa  303  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  39.17 
 
 		 484 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  38.56 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  41.18 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  38.83 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  40.05 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>