More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3552 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3552  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 490 aa  994    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.314988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1389  aspartate ammonia-lyase  54.57 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0123141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  51.31 
 
 		 476 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1630  aspartate ammonia-lyase  52.71 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1493  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  47.71 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  47.05 
 
 		 461 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  50.59 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1842  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  49.12 
 
 		 484 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0476  aspartate ammonia-lyase  46.85 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0491  aspartate ammonia-lyase  46.85 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0184  fumarate lyase  51.42 
 
 		 488 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  43.53 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  43.66 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  42.48 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0246  aspartate ammonia-lyase  45.47 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.050707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  43.76 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  43.86 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  42.7 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  44.23 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  42.7 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  40.73 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  45.39 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  42.7 
 
 		 477 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  41.98 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  43.97 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  41.98 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  42.95 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  41.76 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  43.76 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  42.32 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  42.52 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  43.36 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  43.26 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  41.98 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  42.3 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  42.08 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  42.08 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  42.08 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  46.51 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  42.08 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  43.38 
 
 		 476 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  44.54 
 
 		 471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  43.44 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  40.79 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  40.79 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  42.95 
 
 		 476 aa  359  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  42.61 
 
 		 484 aa  359  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  42.95 
 
 		 476 aa  358  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  40.86 
 
 		 474 aa  358  9e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1360  aspartate ammonia-lyase  42.61 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.949165  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  43.16 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  42.73 
 
 		 476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  42.73 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  42.73 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  42.73 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  40.57 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 471 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  42.89 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  41.01 
 
 		 485 aa  355  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  44.1 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  42.3 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  42.3 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  42.3 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  42.3 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  44.4 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  44.18 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  44.18 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  42.67 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  42.7 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  41.09 
 
 		 463 aa  352  7e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  43.38 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  43.38 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  41.67 
 
 		 475 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  44.84 
 
 		 468 aa  350  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  42.36 
 
 		 478 aa  348  8e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  42.98 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  41.67 
 
 		 475 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  42.18 
 
 		 521 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  42.89 
 
 		 560 aa  346  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  46.63 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  41.46 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  42.23 
 
 		 568 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  40.31 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  46.63 
 
 		 468 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  41.91 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  41.11 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  42.14 
 
 		 468 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  42.23 
 
 		 571 aa  339  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  41.14 
 
 		 467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  39.61 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  40.74 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  38.96 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  43.27 
 
 		 483 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  41.74 
 
 		 474 aa  336  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>