More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0184 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0184  fumarate lyase  100 
 
 
488 aa  979    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  63.42 
 
 
476 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  61.75 
 
 
484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  60.09 
 
 
472 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  59.75 
 
 
498 aa  569  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  54.61 
 
 
461 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  53.12 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  51.18 
 
 
471 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1630  aspartate ammonia-lyase  53.68 
 
 
470 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1842  aspartate ammonia-lyase  53.12 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  47.63 
 
 
479 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  47.66 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  47.87 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  47.66 
 
 
477 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
477 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1389  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
470 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0123141  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
477 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
477 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
477 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  47.02 
 
 
477 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  47.66 
 
 
477 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
477 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  47.66 
 
 
477 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 
466 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1493  aspartate ammonia-lyase  52.6 
 
 
471 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 
470 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  50.87 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  47.53 
 
 
479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  46.67 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  46.67 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  46.88 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  47.32 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  46.67 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  46.67 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  50.44 
 
 
471 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  52.47 
 
 
479 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  48.82 
 
 
481 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 
471 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  50.11 
 
 
471 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  50.65 
 
 
468 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  47.54 
 
 
476 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  48.37 
 
 
469 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  46.88 
 
 
479 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  47.11 
 
 
476 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  46.88 
 
 
479 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  47.32 
 
 
476 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  46.88 
 
 
479 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  47.32 
 
 
476 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  49.14 
 
 
474 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  47.11 
 
 
476 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  46.88 
 
 
479 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
468 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  47.94 
 
 
521 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
468 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  47.11 
 
 
476 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  47.11 
 
 
476 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 
466 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
475 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  47.19 
 
 
475 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 
466 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  47.35 
 
 
479 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
471 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  45.38 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
468 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  47.41 
 
 
467 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  46 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  47.94 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  45.38 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  47.06 
 
 
485 aa  415  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  49.13 
 
 
475 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  49.78 
 
 
481 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  47.64 
 
 
469 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  47.98 
 
 
474 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  46.19 
 
 
475 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 
475 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  45.38 
 
 
468 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  45.34 
 
 
474 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  48.9 
 
 
540 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  49.43 
 
 
483 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0491  aspartate ammonia-lyase  48.04 
 
 
458 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3552  aspartate ammonia-lyase  51.42 
 
 
490 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.314988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  49.24 
 
 
474 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0476  aspartate ammonia-lyase  48.04 
 
 
458 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  49.43 
 
 
483 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  49.24 
 
 
474 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 
478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  45.53 
 
 
476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 
478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
463 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  47.71 
 
 
474 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  45.75 
 
 
505 aa  405  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 
485 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 
468 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 
485 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  45.53 
 
 
468 aa  402  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 
468 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  48.28 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 
482 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>