More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1630 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1630  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 470 aa  957    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1493  aspartate ammonia-lyase  71.18 
 
 		 471 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1842  aspartate ammonia-lyase  65.09 
 
 		 470 aa  601  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  54.9 
 
 		 476 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  54.98 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1389  aspartate ammonia-lyase  57.21 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0123141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0184  fumarate lyase  53.68 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  52.79 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3552  aspartate ammonia-lyase  52.71 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.314988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0476  aspartate ammonia-lyase  49.56 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0491  aspartate ammonia-lyase  49.56 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  47.6 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  48.91 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  48.39 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  49.02 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  48.7 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  44.96 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  48.8 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  48.69 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  48.69 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  44.54 
 
 		 479 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  47.06 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  45.2 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  45.2 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  44.08 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  43.86 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  43.86 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0246  aspartate ammonia-lyase  47.49 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.050707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  46.87 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  47.98 
 
 		 479 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  47.36 
 
 		 521 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1360  aspartate ammonia-lyase  45.63 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.949165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  44.1 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  45.73 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  46.07 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  43.72 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  46.07 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  43.7 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  47.17 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  45.89 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  45.87 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  47.61 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  47.17 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  46.51 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  47.17 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  48.03 
 
 		 481 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  44.1 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  44.1 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  44.1 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  44.1 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  44.1 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  47.29 
 
 		 468 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  44.1 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  45.95 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  47.17 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  46.74 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  46.71 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  45.4 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  46.65 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  46.03 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  46.85 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  46.52 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  46.03 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  42.76 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  45.65 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  42.76 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  44.64 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  46.64 
 
 		 474 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  44.63 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  42.76 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  42.76 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  43.33 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  45.67 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>