More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0476 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0491  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 458 aa  939    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0246  aspartate ammonia-lyase  70.33 
 
 		 459 aa  657    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.050707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0476  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 458 aa  939    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1360  aspartate ammonia-lyase  72.59 
 
 		 454 aa  667    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.949165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 498 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1630  aspartate ammonia-lyase  49.56 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  49.56 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1493  aspartate ammonia-lyase  50.36 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1389  aspartate ammonia-lyase  46.57 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0123141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3552  aspartate ammonia-lyase  46.9 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.314988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1842  aspartate ammonia-lyase  47.08 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0184  fumarate lyase  48.04 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  45.55 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  45.22 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  45.97 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  44.13 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  43.01 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  43.36 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  43.86 
 
 		 477 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  42.52 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  45.09 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  45.09 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  43.7 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  42.27 
 
 		 479 aa  359  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  42.03 
 
 		 479 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  43.36 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 		 474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  45.54 
 
 		 540 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  43.67 
 
 		 474 aa  355  8.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  43.33 
 
 		 477 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  43.56 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  43.33 
 
 		 477 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  43.23 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  44.35 
 
 		 481 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  43.33 
 
 		 477 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  43.33 
 
 		 477 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  43.01 
 
 		 521 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  44.21 
 
 		 466 aa  352  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  43.76 
 
 		 471 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  43.11 
 
 		 477 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  42.54 
 
 		 477 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  42.76 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  43.11 
 
 		 477 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  43.11 
 
 		 477 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  43.11 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  42.76 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  42.76 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  44.64 
 
 		 482 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  42.09 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.64 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  42.48 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  45.67 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  43.36 
 
 		 478 aa  344  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  45.32 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  45.32 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  45.56 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  42.7 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  42.89 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  42.7 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  44.71 
 
 		 469 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  43.01 
 
 		 475 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 476 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  42.52 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  42.3 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  42.21 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  43.81 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  42.01 
 
 		 470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  40 
 
 		 468 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  43.2 
 
 		 474 aa  339  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  44.6 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  43.21 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  41.92 
 
 		 507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  42.67 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  45.32 
 
 		 468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  40.52 
 
 		 469 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  43.33 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.98 
 
 		 471 aa  334  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  41.05 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  41.27 
 
 		 571 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  41.27 
 
 		 560 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  44.6 
 
 		 468 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  44.12 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  44.12 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  41.27 
 
 		 568 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  44.12 
 
 		 478 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>