More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0119 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0119  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 430 aa  874    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  29.09 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  33.94 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  33.41 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  28.22 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  30.55 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  31.39 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  28.64 
 
 		 463 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  30.72 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  29.11 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  29.11 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  29.11 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  31.37 
 
 		 464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  32.16 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  29.26 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  29.26 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  29.26 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  29.26 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  29.26 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  29.26 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  28.69 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  29.26 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  29.26 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  28.6 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  28.1 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  26.52 
 
 		 489 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  27.15 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  26.99 
 
 		 483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  28.3 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  29.11 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  26.96 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  26.37 
 
 		 484 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  28.37 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  26.33 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  26.49 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  28.31 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  26.33 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  26.23 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  28.91 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  26.71 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  27.23 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  28.95 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  29.49 
 
 		 474 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  27.1 
 
 		 472 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  27.63 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  26.11 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  26.4 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  26.01 
 
 		 473 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  25.84 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  26.99 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  28.51 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  25.84 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  25.6 
 
 		 481 aa  167  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  26.27 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  26.68 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  26.68 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  26.44 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  26.68 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  26.44 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  26.68 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  25.06 
 
 		 475 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  25.39 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  25.06 
 
 		 485 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  26.21 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  30.22 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  27.52 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  24.44 
 
 		 478 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  24.83 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  30.21 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  26.82 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  25.41 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  25.27 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  24.82 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  25 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  25.11 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  25.11 
 
 		 479 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  25.28 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  25.67 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  25.92 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  25.42 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  25.32 
 
 		 474 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  27.35 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  26 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  25.69 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  26.13 
 
 		 489 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  27.93 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  26.44 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  24.22 
 
 		 472 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  23.81 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  24.03 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  25.29 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  24.09 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  24.68 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  25.75 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  25.22 
 
 		 466 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  27.35 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  24.19 
 
 		 485 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  23.96 
 
 		 485 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  24.4 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>