More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0049 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  100 
 
 		 372 aa  738    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1459  FeS assembly protein SufD  40.61 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1413  FeS assembly protein SufD  40.11 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  36.29 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  38.97 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  28.35 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  32.05 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  35.94 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  34.42 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  33.12 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  33.12 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  33.12 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  33.12 
 
 		 430 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  33.12 
 
 		 430 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  34.25 
 
 		 435 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  28 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  33.12 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  33.12 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  33.12 
 
 		 430 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  33.12 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  33.12 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 		 437 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  32.88 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  32.88 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  40.59 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  35.48 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  36.11 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  33.93 
 
 		 420 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  34.58 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  31.3 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  35.94 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26800  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  25.13 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  24.52 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  21.7 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  30.3 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  28.7 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  24.1 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1638  SufBD protein  25.37 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.822468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  26.41 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  24.1 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  23.89 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  33.07 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  25.81 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2272  SufBD protein  25.91 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  23.39 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12900  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  25 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  25.32 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  26.21 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  24.24 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  25.9 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  23.64 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  25 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  23.91 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  26.03 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  31 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  32.32 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  24.04 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  27.59 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  27.59 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  22.62 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  23.18 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.94 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  23.5 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  22.62 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  23.83 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  23.15 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  21.8 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  23.83 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  21.68 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  33.03 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.37 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  19.73 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  25 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  23.74 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  21.61 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  22.54 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  23.36 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.66 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  30.17 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  23.92 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  26.21 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  19.53 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  26.54 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.51 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.21 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  27.54 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  25 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  23.79 
 
 		 846 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  19.41 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0561  SufBD protein  21.46 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.16 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  22.89 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  23.92 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  22.89 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49608  FeS assembly protein suf  24.54 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.17 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  22.89 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  22.68 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>